Красная книга 

Занесенные в Красные книги растения и животные подлежат особой охране. За их уничтожение взимаются штрафы и возмещение ущерба. Красная Книга — это юридический документ, на основании которого предпринимаются меры по защите и сохранению редких видов растений и животных вплоть до уголовного преследования лиц, причастных к их уничтожению. 

Растения 

На территории резервата отмечено 32 вида различных категорий редкости, что составляет около 7,5% от общего числа флоры высших растений. Ведущими в группе редких являются растения, занесённые в Красную книгу Казахстана:

  1. Камыш казахстанский (Scirpus kasachstanicus Dobroch), семейство Осоковые – Cyperaceae. Корневищный многолетник, 100-300 см высотой, с трехгранным стеблем и густым соцветием, 8-12 см длиной, с неравными веточками. Растет в пресных и солоноватых проточных водах. Описан в 1950 г. К.В. Доброхотовой по экземплярам, собранным ею 17.08.1946 г. в Семизкульской протоке близ поселка Семизкуль.
  2. Тополь сизолистный, туранга сизолистная (Populus pruinosa Schrenk), семейство Ивовые – Salicaceae. Мощное дерево, до 10-16 м высотой, с широкой кроной и сероватой корой. Листья кожистые, сизоватые, гладкие, цельнокрайние (в чём главное внешнее отличие от более широко распространенного на территории вида – туранги разнолистной).
  3. Болотноцветник щитолистный (Nymphoides peltatum (S.G.Gmel) O. Kuntze), семейство Вахтовые – Menyanthaceae. Многолетнее водное укореняющееся растение с длинным ползучим корневищем и округло-эллиптическими листьями, от 3 до 10 см длиной и 2-5 см шириной, с длинными черешками. На сегодняшний день популяции находятся в благоприятном состоянии; взрослые растения обильно цветут и плодоносят.
  4. Альдрованда пузырчатая (Aldrovanda vesiculosa L.), семейство Росянковые – Droseraceae. Многолетние свободноплавающие водные растения с тонкими нитевидными стеблями и мутовчато расположенными листьями. Особенностью морфологического строения альдрованды, насекомоядного растения, является двустворчатая пластинка листа, которая захлопывается, складывается вдвое по средней жилке после захвата насекомого. Редкий реликтовый вид, численность которого повсеместно сокращается. Встречается в водах озёр и протоков.
  5. Лотос орехоносный (Nelumbo nucifera Gaertn.), семейство Лотосовые — Nelumbonaceae. Многолетнее водное укореняющееся растение, редкий реликтовый вид, заносный в Казахстане. Во второй половине ХХ века был натурализован в дельте р. Иле, озере Караколь (Красная книга, 1981). Данных о современном состоянии вида здесь нет, необходимы специальные дополнительные исследования.
  6. Барбарис илийский (Berberis iliensis M. Pop.), семейство Барбарисовые – Berberidaceae. Ветвистый колючий кустарник, до 3 м высотой, эндемик Илийской долины. Редкий вид, с сокращающимся ареалом и численностью (Красная книга, 1981). Наиболее обычен в тугайных зарослях поймы р. Иле и ее притоков. На территории резервата встречается по берегам р. Иле и протоков, а также на островах в районе бывшего пионерлагеря (5 км выше пос. Баканас). В незначительном обилии он представлен здесь в составе туранговых рощ (из Populus diversifolia, джидовников, а также ивово-лоховых зарослей).
  7. Жимолость илийская (Lonicera iliensis Pojark.), семейство Жимолостные – Caprifoliaceae. Ветвистый кустарник, с многочисленными крепкими тонкими ветвями, узкими листьями и черновато-сизыми, почти шаровидными плодами. Редкий эндемичный вид, распространенный в долине р. Иле (от окрестностей Хорогоса до Баканаса), ущельях прилегающих хребтов Северного Тянь-Шаня и Джунгарского Алатау. На территории резервата отмечен в тех же местах и в тех же сообществах, что и барбарис илийский, но в несколько большем обилии.

На территории отмечены 7 реликтовых видов нуждающихся в особой охране и представляющих научный интерес:

А также 18 эндемиков Казахстана:

Животный мир

Рыбы 

В Красную книгу Казахстана внесено 3 вида – балхашский окунь (Perca schrenkii), шип (Acipenser nudiventris) и короткоголовый усач (Barbus brachycephalus).

Земноводные 

В дельте реки Иле из числа редких и исчезающих земноводных, внесенных в Красную Книгу Казахстана, известно обитание только одного вида – центральноазиатской лягушки (Rana amurensis). Численность и ареал вида в последнее время катастрофически сокращается. Она исчезла в местах былого обитания по рекам Иле, Алматинка, Каскеленка, Чемолган и в окрестностях г.Алматы, где раньше была обычной. В настоящее время в Илийской долине она сохранилась только в низовьях     р. Чарын в границах Чарынского национального парка.

Пресмыкающиеся 

Редкие виды пресмыкающихсяна территории резервата не отмечены. 

Птицы 

Дельта Иле является самой крупной в Казахстане естественной дельтой и одним из наиболее значимых в Центральной Азии водно-болотных угодий, имеющих международное значение в качестве мест массового гнездования водоплавающих и околоводных птиц, а также скоплений во время миграций, в том числе и глобально угрожаемых видов.

Достаточно отметить, что в Красную книгу Республики Казахстан, включающей 56 видов птиц, внесено 33 обитающих здесь редких и исчезающих видов птиц, из них 19 являются гнездящимися, 11 – мигранты и 3 – залетные.

Особенно важна эта территория в качестве места гнездования кудрявого и розового пеликанов, колпицы, савки, белоглазой чернети, орлана-белохвоста, а прилежащие пустыни – саксаульной сойки, саджи, чернобрюхого рябка.

Большую важность водно-болотные угодья имеют также в качестве мест линьки и остановок мигрирующих птиц.

К категории глобально угрожаемых видов птиц, занесённых в Красные списки МСОП, относится 20 видов, из них гнездящимися являются 8: кудрявый пеликан, савка, белоглазая чернеть, могильник, степная пустельга, дрофа-красотка, бурый голубь, сизоворонка.

*Примечание: B- гнездящийся; М – мигрант; V- залётный; O – оседлый вид.

٭٭I категория – исчезающие (виды или подвиды, находящиеся под угрозой исчезновения, в том числе и возможно уже исчезнувшие, так как информации по ним нет уже несколько лет, но не более 50);

II категория – сокращающиеся (виды, численность которых относительно высока, но сокращается катастрофически быстро, что в недалеком будущем может привести эти виды в категорию исчезающих);

III категория – редкие (виды, которым в настоящее время не грозит исчезновение, но встречаются они в таком небольшом количестве или на таких небольших территориях, что легко могут исчезнуть при неблагоприятном изменении среды обитания под воздействием природных или антропогенных воздействий);

IV категория – неопределенные (виды, образ жизни которых изучен недостаточно, а численность и состояние популяций вызывают тревогу, однако недостаток сведений не позволяет отнести их ни к одной из перечисленных категорий);

V категория – восстановленные (виды, состояние которых, благодаря принятым мерам охраны, не вызывает более опасений, но они не подлежат еще промысловому использованию и за их популяциями необходим еще постоянный контроль).

Примечание: * CR: critically endangered – находящиеся на грани полного исчезновения (критически угрожаемые); EN: endangered – исчезающие (угрожаемые); VU: vulnerable – уязвимые; CD: conservation dependent – зависящие от охраны (нуждающиеся в охране); DD: data deficient – статус не определен (недостаток данных); NT: near threatened – «близкие к угрожаемым», т.е. виды, которые могут в будущем попасть под угрозу.

Млекопитающие 

Из 39 видов млекопитающих, обитающих в дельте р.Иле, 3 вида внесены в Красную Книгу Казахстана:

  1. Перевязка (Vormela peregusna)

Спорадично распространена в пустынных и полупустынных ландшафтах вплоть до остепнённых предгорий. Вид занесён в Красную Книгу Казахстана со статусом 3 категории. Редкий зверек с быстро сокращающимся ареалом. Единственный вид монотипичного рода в фауне СНГ. Наиболее часто встречается в закрепленных, слабобугристых песках, поросших саксаулом, терескеном, джузгуном, караганой, астрагалами, чередующихся с глинистыми равнинами. Численность подвержена резким колебаниям, что, очевидно, связано с численностью основных объектов питания (песчанки и суслики).

  1. Джейран (Gazella subguttorosa) 

Встречается на территории Южного Прибалхашья. Вид занесён в Красную Книгу Казахстана со статусом 3 категории. Редкий вид. Численность и местообитания в ряде районов сокращаются. Единственный представитель рода газелей и подсемейства антилоп в Казахстане, где находится северная часть его ареала. Места обитания джейранов – закрепленные бугристые пески, щебнистые и глинистые пустыни, пересеченные сухими руслами, покрытые зарослями саксаула, джузгуна, боялыча, терескена или открытые щебнистые пространства с саксаульниковыми или тасбиюргуновыми пастбищами.

  1. Бледный карликовый тушканчик (Salpingotus allidus) 

Обитает в Южном Прибалхашье на сглаженных песчаных плакорах. Занесён в Красную Книгу Казахстана со статусом 3 категории. Места обитания – мелкозернистые перевеянные пески различного рельефа. Численность в Южном Прибалхашье подвержена заметным колебаниям по годам.